Im Jahr 1297 gab es eine Pfarrei, die der Jungfrau Maria gewidmet war, zu der die kleineren Kirchen von Cortelà und Castelnuovo gehörten.
Zwei Jahrhunderte später, im Jahr 1536, beschloss der damalige Erzpriester Francesco Riorno, auf die Pfarrei und ihr Eigentum zu verzichten, das auf Entscheidung von Papst Paul III. dem Olivetaner Kloster am Monte Venda unterstellt wurde.
Als die Venedische Republik 1771 die Aufhebung des Klosters beschloss, kam die Pfarrei Boccon wieder unter die territoriale Kontrolle des Bistums Padua; jedoch beanspruchte die Familie Erizzo, Eigentümerin des Klosterbesitzes, das Patronatsrecht über die Kirche.
Das Gebäude wurde in den 30er Jahren des 20. Jahrhunderts grundlegend renoviert.